Nelle applicazioni di supervisione si presenta spesso il problema della sicurezza. Normalmente solo alcune categorie di operatori hanno diritto di accedere a particolari aree del sistema. In Navis la definizione di un Utente permette di validare l'accesso al sistema dello stesso con Nome Utente e Password, permettendo la validazione delle operazioni in funzione del suo Livello. Chi sviluppa la applicazione potrà, ad esempio, permettere la visualizzazione o la modifica di alcuni valori bloccando l'accesso se il livello dell'utente attuale non è superiore ad un particolare valore. Il sistema mette a disposizione una serie di funzioni per interagire, in fase di esecuzione, con le proprietà degli utenti.

Gli utenti possono essere configurati in fase di design secondo le proprietà sotto visualizzate. La configurazione e/o la creazione di nuovi utenti può avvenire anche in esecuzione utilizzando le funzioni di sistema relative agli utenti (Users) .